巴里的历史可追溯至古罗马帝国时代。其时巴里位处古罗马交通要道上，属一个交汇点。中世纪时巴里屡受战火破坏，更一度被伊斯兰人入侵占据达二十年。文艺复兴时代，巴里为那不勒斯王国之一部份，后来在十九世纪成为意大利王国之一部份。